可变剪接在结肠、膀胱和前列腺癌被外显子阵列分析。
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于K,索伦森KD, Brems-Eskildsen, Modin C, Gaustadnes M,嗯,Kruhoffer M, Laurberg年代,Borre M,王K,椰子饼,报告中AR, tor N, Dyrskjot L,安徒生CL, Orntoft特遣部队
可变剪接在结肠、膀胱和前列腺癌被外显子阵列分析。
摩尔细胞蛋白质组学。2008年7月,7 (7):1214 - 24。doi: 10.1074 / mcp.M700590-MCP200。Epub 2008年3月18日。
- PubMed ID
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18353764 (在PubMed]
- 文摘
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可变剪接提高蛋白质组多样性和调节癌症相关的蛋白质。识别组织和肿瘤特异性可变剪接,我们使用了GeneChip人类外显子1.0阵列测量全基因组外显子表达102年正常和癌组织样品的不同阶段结肠、膀胱和前列腺癌。我们确定了2069个候选可变剪接事件之间的正常组织样本结肠、膀胱、前列腺和选择15剪接事件rt - pcr验证、10的成功验证了rt - pcr和测序。此外23日19日和18候选人在结肠肿瘤特异性剪接改变,膀胱、前列腺,分别选择81 rt - pcr验证一组独立的正常和肿瘤组织样本。总共7个基因与肿瘤特异性剪接变体被确定(ACTN1、CALD1 COL6A3, LRRFIP2, PIK4CB, TPM1,和VCL)。验证肿瘤特异性剪接改变高度一致,使正常和癌症的明确分离样品和在某些情况下甚至不同肿瘤的阶段。肿瘤特异性剪接改变的一个子集(ACTN1 CALD1, VCL)被发现在所有三个器官和可能代表一般癌症相关的剪接事件。在硅蛋白预测表明,确定癌症特异性剪接变体编码蛋白质可能改变功能,表明它们可能参与发病机理,因此代表新的治疗目标。总之,我们确认和验证正常组织样本之间的可变剪接结肠、膀胱、前列腺除了癌症特异性剪接事件在结肠、膀胱和前列腺癌的诊断和预后的影响。