质谱分析揭示了模块化和一个完整的单元交互地图eIF3真核翻译的因素。
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周,Sandercock,弗雷泽CS Ridlova G,斯蒂芬斯E, Schenauer先生,Yokoi-Fong T, Barsky D, Leary是的,好时JW, Doudna是的,罗宾逊的简历
质谱分析揭示了模块化和一个完整的单元交互地图eIF3真核翻译的因素。
《美国国家科学院刊S a . 2008年11月25日,105 (47):18139 - 44。doi: 10.1073 / pnas.0801313105。Epub 2008 7月1。
- PubMed ID
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18599441 (在PubMed]
- 文摘
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真核起始因子3 (eIF3)中扮演一个重要的角色在翻译起始,充当对接网站数型双40 s核糖体亚基组装。在这里,我们使用质谱到探测器子单元相互作用在人类复杂。我们的结果表明,13-subunit复杂可以维持完整的气相,使我们能够建立明确其化学计量学和通过串联质谱分析和解决方案总体单元体系结构破坏实验。离解发生离子强度的函数到形成三个稳定的模块(c: d: e:李:k), eIF3 (f: h: m)和eIF3 (b:我:g)。这些模块是联系在一起的单元之间的交互eIF3b: c和eIF3c: h。我们确认我们的互动地图同源酵母eIF3复杂包含五个核心子单元中发现人类eIF3和免疫沉淀反应的补充我们的数据和结果。这些结果,连同27日复形与离子强度增加,使我们能够定义一个全面互动地图这800 kda的物种。我们的互动地图允许比较自由eIF3与绑定到C型肝炎病毒内部核糖体进入位点(HCV-IRES) RNA。我们也比较eIF3互动地图与相关配合物,包含进化保存蛋白质域,显示单元的位置包含RNA识别图案近端解码中心40 s亚基的核糖体。