核磁共振结构的三个准RNA识别图案(qRRMs)人类hnRNP F和交互研究Bcl-x G-tract RNA:小说的RNA识别模式。
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Dominguez C,艾蓝跳频
核磁共振结构的三个准RNA识别图案(qRRMs)人类hnRNP F和交互研究Bcl-x G-tract RNA:小说的RNA识别模式。
核酸研究》2006年8月2日,34 (13):3634 - 45。打印2006。
- PubMed ID
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16885237 (在PubMed]
- 文摘
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异构核核糖核蛋白(hnRNP) F属于hnRNP H家庭参与可变剪接的规定和聚腺苷酸化,特别是认识到保利(G)序列(G-tracts)。特别是,hnRNP F结合的G-tract Bcl-x RNA和调节其可变剪接,导致两个亚型,Bcl-x (S)和Bcl-x (L),与对手的功能。为了了解G-tract识别hnRNP H成员,我们发起了一个人类hnRNP F NMR研究我们提出的解决方案结构三个准RNA识别图案(qRRMs) hnRNP F和识别重要的残留与Bcl-x RNA的交互通过核磁共振化学位移扰动和诱变实验。三个qRRMs展览规范化betaalphabetabetaalphabeta RRM褶皱但其他二级结构元素存在于两个氨基端qRRMs hnRNP f .我们表明qRRM1 qRRM2但不是qRRM3负责G-tract识别的残留qRRM1和qRRM2参与G-tract交互并不像观察β褶板表面的古典RRM但短beta-hairpin和两个相邻循环的一部分。这些区域定义一个新的RNA相互作用表面由名RRMs识别。