验证的分子对接程序对dihydropteroate合成酶虚拟筛选。

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Hevener KE,赵W,球DM, Babaoglu K,气J,白色的西南,李再保险

验证的分子对接程序对dihydropteroate合成酶虚拟筛选。

J化学正模型。2009年2月,49 (2):444 - 60。doi: 10.1021 / ci800293n。

PubMed ID

19434845 (在PubMed

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Dihydropteroate合成酶(井下供电)的目标是磺胺类抗生素和抗菌药物验证目标近70年。磺酰胺类目标p-aminobenzoic酸(pABA)结合位点的井下供电和干扰叶酸生物合成,最终防止细菌复制。然而,这些药物细菌耐药性普遍严重限制了它们的有效性。本研究探讨了第二和更多的高度保守的蝶呤结合位点的井下供电作为替代方法开发新型抗生素,避免阻力。在这项研究中,五个常用的对接项目,FlexX, Surflex,滑翔,黄金,码头,和九个得分函数,进行评估的能力等级次序潜在铅化合物广泛的虚拟筛选研究炭疽杆菌井下供电的蝶呤结合位点。他们的表现在配体对接和得分被他们的繁殖能力判断一个已知的抑制剂构象和有效地检测已知活性化合物播种成三个独立的诱饵。另外两个指标被用来评估性能;浓缩在1%和2%和接受者操作特征(ROC)曲线。改之前的有效性postdocking放松和共识得分也被评估。最后,我们开发出了一种简单的统计方法包括已知活性化合物的抑制常数分析浓缩结果更准确地评估得分表现,我们称之为“日志等级之和的总和”或SSLR。 Of the docking and scoring functions evaluated, Surflex with Surflex-Score and Glide with GlideScore were the best overall performers for use in virtual screening against the DHPS target, with neither combination showing statistically significant superiority over the other in enrichment studies or pose selection. Postdocking ligand relaxation and consensus scoring did not improve overall enrichment.

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
磺胺醋酰	Dihydropteroate合酶	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节