UUAG-specific RNA结合蛋白,核核糖核蛋白D0异构。常见的模块化结构和2 xrbd-gly家族的绑定属性。
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郎Kajita Y, Nakayama J, Aizawa M,石川F
UUAG-specific RNA结合蛋白,核核糖核蛋白D0异构。常见的模块化结构和2 xrbd-gly家族的绑定属性。
J生物化学杂志。1995年9月22日,270 (38):22167 - 75。
- PubMed ID
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7673195 (在PubMed]
- 文摘
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人类cDNA克隆编码UUAG-binding异构核核糖核蛋白(hnRNP) D0蛋白质已经被分离出来并表达。蛋白质有两个rna结合域(rbd)中间的一部分蛋白质和一个RGG框,一个地区富含甘氨酸和精氨酸残基,c端部分(“2 xrbd-gly”结构)。hnRNP A1, A2 / B1, D0蛋白质,所有拥有共同特征的2 xrbd-gly结构和绑定特异性RNA。在一起,他们形成一个亚科RBD类的RNA结合蛋白(2 xrbd-gly家族)。这些蛋白质共享的结构特点之一是几个亚型的存在可能导致选择性剪接。滤波器结合化验,使用重组hnRNP D0蛋白质的两个RBD,表明一个RBD专门结合UUAG序列。然而,两个亚型有或没有19-amino酸插入在氨基RBD显示不同的偏好对突变体RNA基质。19-amino酸插入位于n端第一RBD的结束。这个结果建立N末端RBD的参与在确定序列特异性的绑定。类似的插入也报道hnRNP A2 / B1蛋白质。 Thus, it might be possible that this type of insertion with the 2xRBD-Gly type RNA binding proteins plays a role in "fine tuning" the specificity of RNA binding. RBD is supposed to bind with RNA in general and sequence-specific manners. These two discernible binding modes are proposed to be performed by different regions of the RBD. A structural model of these two binding sites is presented.