结构和与RNA相互作用的氨基端UUAG-specific hnRNP D0的RNA结合域。
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经营T,栗原市Y,松田G,火箭J, Kohno T,柳田Y,石川F,上杉年代,Katahira M
结构和与RNA相互作用的氨基端UUAG-specific hnRNP D0的RNA结合域。
J杂志。1999年3月26日,287 (2):221 - 37。
- PubMed ID
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10080887 (在PubMed]
- 文摘
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异构核核糖核蛋白(hnRNP) D0有两个核糖核蛋白(RNP)类型的rna结合域(rbd),每一种都可以单独绑定到UUAG序列。结构的n端RBD (RBD1)下面是由核磁共振。它折叠成一个紧凑的alphabeta结构组成的一个四股反平行的β褶板包装对两个阿尔法螺旋的特点RNP-type rbd。RBD1的特殊结构特点包括N-capping盒为阿尔法螺旋,在第二beta-strand beta-bulge,另一个短反平行的β褶板加上beta-turn-like结构在一个循环中。两个氢键限制循环被确定的位置。骨干共振作业RBD1包裹着r (UUAGGG)透露,整个折叠维护复杂。残留的候选人参与与RNA相互作用被确定的化学位移扰动分析。他们位于中央和周边地区的rna结合表面组成的四股的β褶板,循环,和c端地区。建议非特异性与RNA相互作用是由RNA结合表面的残留在中部地区,而特定的相互作用是由那些在外围地区。也发现RBD1有能力抑制四重的结构的形成。