酶和结构分析对结核分枝杆菌thymidylate激酶抑制剂设计。磷酰基转移机制的新见解。
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Haouz, Vanheusden V, Munier-Lehmann H, Froeyen M, Herdewijn P范Calenbergh年代,Delarue M
酶和结构分析对结核分枝杆菌thymidylate激酶抑制剂设计。磷酰基转移机制的新见解。
生物化学杂志。2003年2月14日,278 (7):4963 - 71。Epub 2002年11月25日。
- PubMed ID
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12454011 (在PubMed]
- 文摘
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化学合成的新化合物设计为结核分枝杆菌TMP激酶抑制剂(TMPK)报道。合成担忧TMP类似物改性的5-position胸腺嘧啶环以及小说与六元糖环化合物。的绑定属性类似物与已知的抑制剂azido-TMP相比,这是假定在这里工作不包括TMP-bound镁(2 +)离子。的晶体结构复杂的化合物,5-CH (2) OH-dUMP, TMPK已经确定在2.0。它揭示了一个主要的构象的羟基与水分子和小构象指向爵士(99)。寻找一个角色爵士(99),我们发现了一个不寻常的催化三分子,或一个质子线,由严格守恒的残留物(包括Glu(6),爵士(99),Arg(95),和Asp(9)),可能有助于使质子化转移PO(3)组。商用的晶体结构bisubstrate模拟P(1) -(腺苷)- P (5) - (thymidine-5”) -pentaphosphate绑定到TMPK 2.45也在报道和揭示了另一个绑定的口袋里的腺嘌呤分子的一部分,而观察是什么在酵母酶在大肠杆菌或结构。这个选择绑定口袋打开方式的设计特定抑制剂的新家庭。