天冬氨酸盐的晶体结构与phosphonoacetamide carbamoyltransferase的结扎,丙二酸酯,CTP或ATP为2.8 a分辨率和中性pH。
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史蒂文斯RC Gouaux我,以至于WN
天冬氨酸盐的晶体结构与phosphonoacetamide carbamoyltransferase的结扎,丙二酸酯,CTP或ATP为2.8 a分辨率和中性pH。
生物化学。1990年8月21日,29(33):7702 - 15所示。
- PubMed ID
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2271529 (在PubMed]
- 文摘
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R-state结构ATP和CTP复合物的天冬氨酸carbamoyltransferase结扎phosphonoacetamide和丙二酸盐已被认定为2.8 a分辨率和中性博士这些结构是由分子置换的方法,解决了精制结晶残差在0.167和0.182之间。三磷酸、核糖和嘌呤和嘧啶的半个ATP和CTP与类似地区的变构域监管二聚体。ATP和CTP相对增加和减少的大小别构部位附近的基地,分别。CTP和ATP在pH值7,gamma-phosphates注定His20也是Lys94附近,而alpha-phosphates专门与Lys94交互。2的氢氧根CTP和ATP Lys60氨基附近。CTP的嘧啶环使特定的氢键别构部位:氨基集团捐赠氢键的主链羰基Ile12 Tyr89和嘧啶环羰基氧接受一个氨基的氢键Lys60;在位置3氮氢嘧啶环连着一个主链NH群Ile12。ATP的嘌呤环也使得大量的交互与别构部位残留:嘌呤的氨基(类似于CTP的氨基)捐赠的氢键主链羰基氧Ile12, N3氮与Lys60的氨基和N1 NH群Ile12氮氢键。CTP的绑定和ATP的别构部位phosphonoacetamide和丙二酸酯不显著改变变构的结构结合位点或变构的域。尽管如此,CTP-ligated结构,平均分离催化三聚减少约0.5,显示一个小的四级结构转向T状态。 In the CTP- and ATP-ligated R-state structures, the binding and occupancy of phosphonoacetamide and malonate are similar and the structures of the active sites are similar at the current resolution of 2.8 A.