结构性基础ArfA-RF2-mediated翻译终止在mrna缺乏停止密码子。

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穆勒Huter P C, Beckert B, Arenz年代,Berninghausen O,贝克曼R,威尔逊DN

结构性基础ArfA-RF2-mediated翻译终止在mrna缺乏停止密码子。

大自然。2017年1月26日,541 (7638):546 - 549。doi: 10.1038 / nature20821。Epub 2016 12月1。

PubMed ID
27906161 (在PubMed
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截断mrna在细菌核糖体停滞不前,缺乏一个终止密码子transfer-messenger获救的RNA (tmRNA),替代救援因素(阿尔发)或ArfB系统。尽管tmRNA-ribosome和ArfB-ribosome结构已经确定,阿尔发承认截断mrna的存在和新兵如何规范化终止释放因子RF2拯救陷入僵局的核糖体尚不清楚。在这里,我们提出一个低温电子显微镜重建70年代大肠杆菌的核糖体停滞在阿尔发和截断mRNA RF2。结构表明,C末端mRNA入口通道内的阿尔发结合小核糖体亚基,解释了阿尔发区分核糖体,截断或长篇mRNA。N末端的阿尔发建立几个与解码RF2域的相互作用,这一发现说明阿尔发新兵RF2停滞的核糖体。此外,阿尔发稳定显示一个独特的构象的开关RF2循环,模仿规范翻译终止状态的指导催化地重要GGQ主题域内的第3 RF2 peptidyl-transferase核糖体的中心。因此,我们的结构不仅揭示了如何阿尔发新兵RF2核糖体,还如何促进RF2的活性构象,使翻译终止在缺乏一个终止密码子。

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50年代核糖体蛋白L4 P60723 细节