TEM-1 β -内酰胺酶酰化过渡态类似物的晶体结构。A类β -内酰胺酶的机制含义。
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Maveyraud L, Pratt RF, Samama JP
TEM-1 β -内酰胺酶酰化过渡态类似物的晶体结构。A类β -内酰胺酶的机制含义。
生物化学。1998 Feb 24;37(8):2622-8。
- PubMed ID
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9485412 (PubMed视图］
- 摘要
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a类TEM-1 β -内酰胺酶的磷酸盐配合物的晶体结构已被确定为2.0 a的分辨率。从化学计量学角度来看，磷酸盐出现在活性位点，与ser70 - ogamma共价结合，在氧阴离子孔中有一个磷酰氧。虽然整体结构与天然酶非常相似(重原子均方根差0.37 A)，但活性位点官能团的位置发生了变化。该活性位点与另一种A类β -内酰胺酶(金黄色葡萄球菌PC1)与相同膦酸盐的复合物的构象也不同[Chen, c.c.h .， et al. (1993) J. Mol. Biol. 234,165-178]。然而，这两种膦酸盐结构都可以被看作是酰基化过渡态的模型，因为在每种膦酸盐结构中，去酰基化水分子似乎都牢固地结合在Glu166羧酸基上。两者结构的主要区别在于Lys73Nzeta和Ser130Ogamma的定位。在金黄色葡萄球菌结构中，这些官能团之间最密切的相互作用是在Lys73Nzeta和Ser70Ogamma之间(2.8 A)，而在tem1结构中，它是在Ser130Ogamma和结合抑制剂的第二个磷酰氧之间(2.8 A)。因此，前者结构可能类似于通过对底物的亲核攻击形成酰基化的四面体物种的过渡状态，其中Lys73Nzeta可能作为一般碱催化反应。TEM-1结构可以被看作是四面体物种分解的过渡态的类似物，其中Ser130Ogamma作为一般酸，协助离去基的离开。A类β -内酰胺酶晶体结构现在可用，导致这些酶催化机制的自洽建议。