三维结构的zinc-containing phosphotriesterase绑定衬底模拟4-methylbenzylphosphonate二乙酯。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
本宁Vanhooke杰,MM, Raushel调频,霍尔顿嗯
三维结构的zinc-containing phosphotriesterase绑定衬底模拟4-methylbenzylphosphonate二乙酯。
生物化学。1996年5月14日,35 (19):6020 - 5。
- PubMed ID
-
8634243 (在PubMed]
- 文摘
-
从假单胞菌Phosphotriesterase diminuta催化的水解速率增强方法对氧磷和相关的乙酰胆碱酯酶抑制剂10 (12)。酶需要双核的金属活性中心和孤立包含2枚锌/亚基。在这里,我们描述的三维结构Zn2 + / Zn2 +取代模拟4-methylbenzylphosphonate二乙酯酶与底物复合体。晶体用于调查属于空间群C2的单胞尺寸= 129.6 a, b = 91.4 a, c = 69.4,β= 91.9度,和两个亚基的不对称单元。模型是由最小二乘分析,提炼名义解决2.1和15.4%的晶体r因子测量x射线数据。在之前报道cadmium-containing酶的结构,桥接配体是carbamylated赖氨酸残留物(赖氨酸169)和氢氧化。3.3的锌离子分离。越埋锌离子包围他55岁,他57岁的赖氨酸169年,301年Asp,桥接氢氧根在三角形双锥体安排cadmium-substituted酶的描述。与八面体配位观察solvent-exposed镉离子越多,然而,第二个锌是四面体地结扎赖氨酸169,他201年,他230年,桥接氢氧根。二乙基4-methylbenzylphosphonate占据一个双核的金属中心附近的磷酰氧基板模拟位于3.5的更多solvent-exposed锌离子。 The aromatic portion of the inhibitor binds in a fairly hydrophobic pocket. A striking feature of the active site pocket is the lack of direct electrostatic interactions between the inhibitor and the protein. This most likely explains the broad substrate specificity exhibited by phosphotriesterase. The position of the inhibitor within the active site suggests that the nucleophile for the hydrolysis reaction is the metal-bound hydroxide.