特定场地的映射人类相扑与磷酸化蛋白质组显示co-modification。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

里昂•IA, D,年轻的C,詹森LJ,维提加尔AC尼尔森毫升

特定场地的映射人类相扑与磷酸化蛋白质组显示co-modification。

Nat Struct杂志。2017年3月24日(3):325 - 336。doi: 10.1038 / nsmb.3366。Epub 2017年1月23日。

PubMed ID

28112733 (在PubMed

]

文摘

小ubiquitin-like修饰符(相扑)转录后修饰(天车)调节核细胞过程。这里我们使用一个增广K0-SUMO蛋白质组学策略识别40765个相扑受体网站和量化的部分贡献6747人类蛋白质。Structural-predictive分析表明赖氨酸驻留在无序区域优先相扑的目标,在显著对比其他广泛的赖氨酸的修改。在我们的数据集,我们发现807 SUMOylated肽被磷酸化co-modified,连同许多SUMOylated肽被ubiquitylation co-modified,乙酰化和甲基化。值得注意的是,9%的确定SUMOylome近端发生磷酸化,和无数SUMOylation网站被发现是完全依赖于之前的磷酸化的事件。SUMO-proximal磷酸化作用主要发生在proline-directed方式,抑制细胞周期蛋白依赖性激酶co-modification动态影响。集体,我们提出一个全面SUMOylated蛋白质组的分析,发现结构偏好相扑和提供系统级的证据之间的显著程度的相声SUMOylation和其他主要铝。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽

的名字	UniProt ID
组蛋白脱乙酰酶5	Q9UQL6	细节
6月二聚蛋白2	Q8WYK2	细节
循环AMP-dependent ATF-1转录因子	P18846	细节
循环AMP-dependent ATF-3转录因子	P18847	细节
循环AMP-dependent ATF-4转录因子	P18848	细节
循环AMP-dependent转录因子ATF-6α	P18850	细节
生存运动神经元蛋白质	B4DP61	细节
可能ATP-dependent RNA解旋酶DDX5	P17844	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
Homeodomain-interacting蛋白激酶2	Q9H2X6	细节
Homeodomain-interacting蛋白激酶3	Q9H422	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PRP4同族体	Q13523	细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2	Q15910	细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH1	Q92800	细节
DNA甲基转移酶3 (cytosine-5)	Q9Y6K1	细节
DNA甲基转移酶3 b (cytosine-5)	Q9UBC3	细节
Runt-related转录因子2	Q13950	细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1	O60341	细节
信号传感器和转录激活1α/β	P42224	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节
ELAV-like蛋白1	Q15717	细节