拼接调节器在分支点行动腺苷绑定定义的口袋PHF5A-SF3b复杂。
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腾T,蔡JH,濮阳X,西勒米,彭年代,生,Aird D, Buonamici年代,迦勒B,陈B,科森L, Feala J, Fekkes P,杰拉德B, C卡尔,Korpal M,刘X, T劳J, Mizui Y, Palacino J,公园E,史密斯PG,萨勃拉曼尼亚V,吴ZJ邹J, Yu L,国外,Warmuth M,朱拉森N, P
拼接调节器在分支点行动腺苷绑定定义的口袋PHF5A-SF3b复杂。
Nat Commun。2017年5月25日,8:15522。doi: 10.1038 / ncomms15522。
- PubMed ID
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28541300 (在PubMed]
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Pladienolide, herboxidiene和spliceostatin已经被确认为拼接调节器目标SF3B1 SF3b复形。这里我们PHF5A报告,这个复形的另一个组件,也是这些化合物的目标。突变PHF5A-Y36、SF3B1-K1071 SF3B1-R1074 SF3B1-V1078赋予抵抗这些调节器,暗示常见的互动网站。RNA-seq分析表明,PHF5A-Y36C最小影响基底拼接但抑制拼接调节器的全球行动。此外,PHF5A-Y36C改变拼接modulator-induced intron-retention / exon-skipping概要文件,它与相邻的内含子和外显子之间的微分GC含量。我们决定人类的晶体结构PHF5A证明Y36坐落在一个高度保守的表面。低温电子显微镜分析剪接体B (act)复杂显示电阻突变集群在口袋里分叉点周围的腺苷,表明行动的竞争模式。集体,我们提议PHF5A-SF3B1形成一个中央节点绑定到这些拼接调节器。