比较基因组学印加/ C多药耐药性质粒的大肠杆菌和克雷伯氏菌的分离从重症监护室病人和卫生保健机构的全基因组测序的效用。
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哈森,赵L, Boutin妈,Stancil,罗宾逊G,哈里斯广告,Rasko哒,约翰逊JK
比较基因组学印加/ C多药耐药性质粒的大肠杆菌和克雷伯氏菌的分离从重症监护室病人和卫生保健机构的全基因组测序的效用。
Antimicrob代理Chemother。2014年8月,58(8):4814 - 25所示。doi: 10.1128 / AAC.02573-14。Epub 2014 6月9。
- PubMed ID
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24914121 (在PubMed]
- 文摘
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印加/ C质粒已经在传播beta-lactamases牵连的作用,包括基因变异产生耐药性expanded-spectrum头孢菌素,通常最后的治疗耐多药,医院的病原体。bla (FOX-5)基因检测在14个大肠杆菌和16克雷伯氏菌分离培养从肛周的棉签的病人承认一个重症监护病房(ICU)的马里兰大学医学中心(UMMC)在巴尔的摩,马里兰州,历时3年。FOX-encoding隔离的四个获得后续的样本病人最初的负面AmpC beta-lactamase住进加护病房时,这表明AmpC beta-lactamase-encoding质粒被收购,而病人在ICU。五个大肠杆菌分离株的基因组和六个克雷伯氏菌分离株含bla (FOX-5)被选为基于质粒测序。一个大约167 kb印加/ C质粒编码FOX-5 beta-lactamase,一个CARB-2 beta-lactamase,额外的抗菌素耐药性基因,和重金属抗性基因被确定。另一个几乎相同的FOX-5-encoding印加/ C质粒除了一个变量地区与抗性相关基因也确定了。据我们所知,这些质粒代表第一FOX-5-encoding质粒测序。我们使用比较基因组学来描述一个质粒编码的遗传多样性FOX-5 beta-lactamase相对于11大肠杆菌和克雷伯氏菌分离株的全基因组多样性这个质粒携带。我们的发现证明全基因组测序的效用跟踪的质粒和抗生素抗性基因分布在卫生保健机构中。