glutaminyl-tRNA合成酶的活性部位装配tRNA-mediated诱导契合。

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glutaminyl-tRNA合成酶的活性部位装配tRNA-mediated诱导契合。

生物化学,2006年6月6日,45 (22):6858 - 65。

PubMed ID

16734422 (在PubMed

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基于结构突变分析是用来探测一个不同寻常的分子内相互作用部分埋谷氨酸残基邻大肠杆菌glutaminyl-tRNA合成酶的活性部位(GlnRS)。的晶体结构unliganded GlnRS和GlnRS-tRNA (Gln)复杂的显示,Glu34 Glu73侧链羧化物联系对方只在tRNA-bound状态和相互作用是通过相互诱导契合形成过渡途中发生的极化子米歇利斯复杂。突变酶的稳态和瞬态动力学分析表明,这种分子间联系的形成是一个关键事件,促进适当的活性位点的形成。突变体在两种立场动摇的绑定衬底谷氨酰胺在活性部位间隙的对面,而Glu73似乎扮演一个额外的重要角色通过促进正确的绑定3受体的tRNA毗邻ATP和谷氨酰胺。数据显示存在的多个结构路径绑定的tRNA传播构象转换导致的正确形成谷氨酰胺结合位点。single-turnover动力学分析也建立了Glu34羧酸盐不打直接酶作为催化基础帮助deprotonate tRNA-A76亲核2羟基组。先前提出的消除机制,加上最近histidyl-tRNA合成酶的化学改性的实验系统,强调substrate-assisted催化的磷酸氨酰基腺苷酸可能是一个常见的手段都tRNA合成酶促进氨酰基转移反应的步骤。

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