特定绑定的非甾体抗炎药(非甾体抗炎药),磷脂酶A2:磷脂酶A2之间形成复杂的结构和双氯芬酸2.7决议。
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辛格N, Jabeen T,沙玛,Somvanshi RK,戴伊年代,Srinivasan,辛格TP
特定绑定的非甾体抗炎药(非甾体抗炎药),磷脂酶A2:磷脂酶A2之间形成复杂的结构和双氯芬酸2.7决议。
Acta Crystallogr D Crystallogr杂志。2006年4月,62 (Pt 4): 410 - 6。Epub 2006年3月18日。
- PubMed ID
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16552142 (在PubMed]
- 文摘
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IIA分泌磷脂酶A2 (PLA2) sn-2酯键的酶催化水解glycerophospholipids释放脂肪酸和溶血。为了阐明PLA2在炎症性疾病中的作用并确定的绑定方式非甾体抗炎药(非甾体抗炎药),PLA2的详细三维结构之间形成一个复杂的一组活动花絮PLA2从Daboia russelli pulchella和2 - [(2,6-dichlorophenyl)氨基]benzeneacetic酸(双氯芬酸)已经被确定。预成型的复杂被平衡的蛋白质结晶溶液的混合物0.20硫酸铵和30% PEG 4000。水晶属于空间群P4(3),晶胞参数a = b = 53.0, c = 48.4。结构由molecular-replacement解决方法和改进(结晶)和R(免费)因素,0.192和0.211,分别使用反射2.7决议。结构表明,双氯芬酸占据了一个非常有利的位置的中心substrate-binding疏水通道,允许大量的分子间的相互作用。双氯芬酸的绑定模式涉及的关键与重要的底物残留的交互识别如Asp49 His48 Gly30。此外,它包括三个新的交互涉及与Phe5氯原子,Ala18 Tyr22。它还显示,一个广泛的疏水相互作用网络涉及几乎所有的残留物的substrate-binding疏水通道。双氯芬酸的亲和力是决定使用表面等离子体共振,使平衡常数为4.8 + / - 0.2 x 10(8)米。