衬底和产品交易通过乙酰胆碱酯酶的活性中心峡谷分析了晶体学和平衡绑定。

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伯恩Y·拉迪奇Z, Sulzenbacher G,金正日E,泰勒P, Marchot P

衬底和产品交易通过乙酰胆碱酯酶的活性中心峡谷分析了晶体学和平衡绑定。

J生物化学杂志。2006年9月29日,281 (39):29256 - 67。doi: 10.1074 / jbc.M603018200。Epub 2006年7月12日。

PubMed ID

16837465 (在PubMed

]

文摘

的乙酰胆碱催化水解乙酰胆碱酯酶(疼痛),在自然界中最有效的酶之一,发生在深而窄的基活性中心峡谷。峡谷的入口处,外围阴离子网站提供变构配体结合位点,包括基质。迄今为止,没有衬底结构信息条目的活性中心外围的疼痛或其后续的出口已经被报道。晶体结构互补的老鼠疼痛和不活跃的老鼠疼痛突变与取代催化丝氨酸(S203A),在不同的复合物有四个基板(乙酰胆碱,acetylthiocholine succinyldicholine, butyrylthiocholine),两个non-hydrolyzable底物类似物(m - (N, N, N-trimethylammonio) -trifluoroacetophenone和4-ketoamyltrimethylammonium),和一个反应产物(胆碱)在2.05 - -2.65 a分辨率范围内解决。这些结构,支持的绑定和抑制获得的数据在同一小区,揭示了连续的位置和方向的基质绑定到周边站点和峡谷内进行活性部位,假定的构象为酰化、酰基酶的中间过渡态,不同的位置和方向和外出产品。此外,疼的结构变异与acetylthiocholine复合物和succinyldicholine揭示额外的酶表面的底物结合位点,远到峡谷入口。因此,我们提供一组全面的结构性的步骤导致快照的中间体催化和潜在的调节通过底物结合各种变构酶表面的网站。

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Butyrylthiocholine	胆碱酯酶	蛋白质	人类	未知的	底物	细节

药物酶

药物	酶	类	生物	药理作用	行动
Butyrylthiocholine	胆碱酯酶	蛋白质	人类	未知的	底物	细节