描述特大肠杆菌分离株的全基因组测序分析。
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任罗罗Y, R,丁H, X,罗H,张Y,崔你们L、S
描述特大肠杆菌分离株的全基因组测序分析。
活细胞药物抵抗。2018年3月,24 (2):175 - 180。doi: 10.1089 / mdr.2017.0079。Epub 2017年7月7日。
- PubMed ID
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28686503 (在PubMed]
- 文摘
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有限多个特特征研究大肠杆菌分离株通过全基因组测序和比较它们的遗传特性(WGS),因为这些隔离的稀缺性。在这项研究中,我们确定在2993年碳青霉烯抵抗大肠杆菌分离株的流行来自三家中国医院。特拉隔离被WGS进一步特征,和分子流行病学特点及耐药机制探讨了通过基因流行病学中心的公开平台。24特大肠杆菌分离株筛选从2993大肠杆菌临床分离株和特拉隔离了多个耐药表型。特拉之间的主要血清型鉴定通过WGS包括大肠杆菌O8隔离:H21 (n = 6),大肠杆菌O102:编辑(n = 6),与大肠杆菌O25: H4 (n = 3),和占主导地位的序列类型(ST) ST410 (n = 8), ST405 (n = 6),和ST131 (n = 3)。"编码基因,包括blaIMP-4 (n = 3), blaKPC-2 (n = 2), blaNDM-5 (n = 1),和blaIMP-1 (n = 1)确定了七个隔离。WGS分析可以提供大量的耐药的分子流行病学数据隔离,如血清型,茎序列输入(MLST)类型,质粒经由和耐药因素。由于碳青霉烯是最后治疗致命的大肠杆菌感染,迫在眉睫的是描述传输路线和制定风险管理战略阻止或减缓耐药性的传播机制和节省碳青霉烯。