人肠道中孤胞浆磺基转移酶SULT1C3的表达:转录变异的特征及其功能意义。
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Duniec-Dmuchowski Z, Rondini EA, Tibbs ZE, Falany CN, Runge-Morris M, Kocarek TA
人肠道中孤胞浆磺基转移酶SULT1C3的表达:转录变异的特征及其功能意义。
《药物代谢杂志》2014 Mar;42(3):352-60。doi: 10.1124 / dmd.113.055665。Epub 2013 12月11日。
- PubMed ID
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24335392 (PubMed视图］
- 摘要
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通过对人类基因组的计算分析，确定了膀胱磺基转移酶1C3 (SULT1C3)基因，并提示其包含最后两个外显子(7a/b和8a/b)的重复。虽然含有更下游外显子7b和8b的SULT1C3亚型(SULT1C3d)已在大肠杆菌中表达，结晶并表征了活性，但目前没有证据表明SULT1C3在任何人体组织中表达。利用反转录聚合酶链反应，我们在结直肠腺癌细胞(LS180)、结肠和小肠中检测到SULT1C3 mRNA，但扩增片段含有更多上游外显子7a和8a。3'-快速扩增cDNA末端(RACE)证实LS180细胞中表达的SULT1C3转录本含有7a/8a外显子，而5'-RACE鉴定出非编码外显子1。从LS180和肠RNA中扩增出含有7a/8a外显子的SULT1C3全长转录本，克隆cDNA的体外转录-翻译表明，翻译主要始于框架内三个ATG密码子中的第一个。由于含有外显子7a/8a的SULT1C3 (SULT1C3a)与含有外显子7b/8b的SULT1C3d有30个氨基酸的差异，我们通过生成基于已报道的SULT1C3d晶体结构的结构模型来考虑表达一种或另一种异构体的功能影响。结构比较表明，形成底物结合袋的5个残基在两种异构体之间存在差异，导致沿底物结合袋内壁的电子密度和电荷分布发生变化。这些数据表明，SULT1C3在人肠道中表达，但表明表达的亚型可能与先前描述的亚型在功能上不同。