肝素溶液构象的核磁共振和分子模拟研究。

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马洛伊B，福斯特MJ，琼斯C，戴维斯DB

肝素溶液构象的核磁共振和分子模拟研究。

生物化学杂志1993年8月1日;293 (Pt 3):849-58。

PubMed ID

8352752 (PubMed视图

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摘要

通过nmr光谱和分子建模技术的结合，确定了肝素和去n -硫酸化，再n -乙酰化肝素的溶液构象。1H-和13c -n。这些多糖的光谱已被分配。观察到的1H-1H核Overhauser增强(n.O.e.s)已使用程序NOEMOL模拟[福斯特，琼斯和穆洛伊(1989)J. Mol. Graph. 7,196 -201]，用于由构象能计算得出的分子模型;模拟的相关时间被选择来拟合实验确定的13C自旋晶格弛豫时间。为了使计算的1H-1H n.O.e.s与观测的1H-1H n.O.e.s得到很好的一致，有必要假设多糖分子的重定向运动不是各向同性的，而是一个对称的顶部运动。由此产生的溶液中肝素的模型与x射线衍射技术在纤维状态下确定的模型相似[Nieduszynski, Gardner和Atkins (1977) Am。化学。Soc。计算机协会。 Ser. 48, 73-80].

引用本文的药物库数据

药物

肝素钠