肽GPCR循环模拟的设计和结构表征。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
范教授TC、Kriwacki RW Parrill
肽GPCR循环模拟的设计和结构表征。
生物聚合物。2007年7月,86 (4):298 - 310。doi: 10.1002 / bip.20745。
- PubMed ID
-
17443712 (在PubMed]
- 文摘
-
G protein-coupled受体(GPCRs)控制人类生理和行为的基本方面。知识的结构,特别是循环区域,是有限的,并主要从同源模型获得,诱变数据,低分辨率结构研究,和肽受体模型的高分辨率研究部分。我们开发了一个替代方法结构描述GPCR循环,使用人类S1P(4)第一个细胞外循环(E1)作为模型系统。这种方法使用计算肽设计基于跨膜域(TM)模型结构结合CD和核磁共振光谱。特征肽包含片段模仿TM的自组装细胞外结束2和TM 3隔开E1,包括残留R3.28(121)和E3.29(122)所需的鞘氨醇1-phosphate (S1P)绑定和S1P受体激活(4)受体。S1P(4)循环模拟肽互动专门用一个S1P headgroup模拟,O-phosphoethanolamine(豌豆),就是明证PEA-induced扰动的二硫交联卷曲螺旋第一细胞外循环模拟H (CCE1a)(1)和(15)N骨干酰胺化学变化。CCE1a有能力弱绑定豌豆生物相关的残留R29和E30附近,这对应于R3.28和E3.29长篇S1P受体(4),确认它已经采纳了生物学上相关的构象。我们建议卷曲螺旋的结合TM替换和构象稳定interhelical二硫键是一个通用的设计策略,促进本土一样来自GPCRs for循环结构。