蛋白质组学分析纯蛋白衍生物的结核分枝杆菌。
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普拉萨德TS, Verma R, Kumar年代,Nirujogi RS,萨瑟GJ, Madugundu AK, Sharma J, Puttamallesh VN, Ganjiwale, Myneedu VP, Chatterjee, Pandey, Harsha H, Narayana J
蛋白质组学分析纯蛋白衍生物的结核分枝杆菌。
蛋白质组学。2013年7月19日,10 (1):8。doi: 10.1186 / 1559-0275-10-8。
- PubMed ID
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23870090 (在PubMed]
- 文摘
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背景:纯蛋白衍生物(产后抑郁症)已经被用于半个多世纪作为结核感染的诊断抗原基于延迟型超敏反应。虽然被指定为“净化”,在现实中,产后抑郁症的构成是高度复杂的,仍然是不明确的。在这个报告中,高分辨率质谱应用于了解它的组成成分的复杂性。比较蛋白质组学分析各种产后抑郁症的准备和他们的功能特性可能会帮助缩减相关抗原需要准备一个不那么复杂的、更有力的诊断试剂。结果:68年百诺结核菌素的蛋白质组学分析(PPD-CT68),结核分枝杆菌的结核菌素制备生成,在本研究中进行。PPD-CT68是商用结核菌素的蛋白质成分制备、Tubersol用于结核菌素皮肤测试。使用一个高分辨率LTQ-Orbitrap Velos质谱仪,我们确定了265种不同的蛋白质。确定蛋白质从产后抑郁症牛分枝杆菌与确认,产后抑郁症m . avium,从以前的质量spectrometry-based研究PPD-S2。142年,蛋白质被发现是PPD-CT68之间共享和PPD-S2准备。的354个蛋白质从m . tuberculosis-derived产后抑郁症(即蛋白质PPD-CT68或PPD-S2), 37个蛋白被发现与m . avium产后抑郁症,80人与牛分枝杆菌产后抑郁症。 Alignment of PPD-CT68 proteins with proteins encoded by 24 lung infecting bacteria revealed a number of similar proteins (206 bacterial proteins shared epitopes with 47 PPD-CT68 proteins), which could potentially be involved in causing cross-reactivity. The data have been deposited to the ProteomeXchange with identifier PXD000377. CONCLUSIONS: Proteomic and bioinformatics analysis of different PPD preparations revealed commonly and differentially represented proteins. This information could help in delineating the relevant antigens represented in various PPDs, which could further lead to development of a lesser complex and better defined skin test antigen with a higher specificity and sensitivity.
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