解决方案结构RBCC /修剪B-box1域的人类MID1:变数寄存器和一个戒指。
文章的细节
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引用
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Massiah马,西蒙斯BN,短公里,考克斯TC
解决方案结构RBCC /修剪B-box1域的人类MID1:变数寄存器和一个戒指。
J杂志。2006年4月28日,358 (2):532 - 45。Epub 2006 2月20。
- PubMed ID
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16529770 (在PubMed]
- 文摘
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变数寄存器域的定义特征三方RBCC(戒指,变数寄存器,卷曲螺旋)或减少蛋白质,其中许多是E3泛素连接酶。然而,很少有人知道变数寄存器的生物功能。在一些RBCC /修剪蛋白质只有一个变数寄存器(类型2)领域,而其他人则1型和2型变数寄存器域串联相邻环域。这两种变数寄存器分享小序列相似,除了半胱氨酸和组氨酸残基的存在:八在大多数B-box1域和七B-box2域。我们报告的高清解决方案结构首先B-box1域(从人类RBCC蛋白质,MID1)根据670年核奥佛好塞效应(一)派生的距离限制,12个氢键,44二面角角度。域由一个三轮阿尔法螺旋,两个短beta-strands,和三个beta-turns,包括Val117 Pro164,结合两个锌原子。一个锌原子由半胱氨酸残基119年协调,122年,142年,145年,而半胱氨酸134、137和150年组氨酸,159坐标。这种拓扑是明显不同于其他变数寄存器结构报道;2型的变数寄存器从非洲爪蟾蜍XNF7,它绑定一个锌原子。值得注意的是,B-box1结构相似的折叠戒指,ZZ和U-box域的E3和E4泛素酶,提高的可能性B-box1域E3活动本身或增强的活动环型E3连接(即授予E4酶活性)。 The structure of the MID1 B-box1 also reveals two potential protein interaction surfaces. One of these is likely to provide the binding interface for Alpha 4 that is required for the localized turnover of the catalytic subunit of PP2A, the major Ser/Thr phosphatase.
DrugBank数据引用了这篇文章
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药物 目标 类 生物 药理作用 行动 锌 DNA-3-methyladenine糖基化酶 蛋白质 人类 未知的不可用 细节 乙酸锌 DNA-3-methyladenine糖基化酶 蛋白质 人类 未知的不可用 细节 氯化锌 DNA-3-methyladenine糖基化酶 蛋白质 人类 未知的代数余子式细节 硫酸锌,未指明的形式 DNA-3-methyladenine糖基化酶 蛋白质 人类 未知的代数余子式细节