研究生物碱绑定GC-rich人类生存素启动子DNA使用积极的和消极的离子电喷雾电离质谱分析。

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刘王Z,郭X, Z,崔M,歌F,刘

研究生物碱绑定GC-rich人类生存素启动子DNA使用积极的和消极的离子电喷雾电离质谱分析。

J质量范围。2008年3月,43 (3):327 - 35。

PubMed ID

17968851 (在PubMed

]

文摘

电喷雾电离质谱(质)被用来调查13生物碱的绑定两个GC-rich DNA工器是至关重要的人类生存素启动子序列。负离子质首次应用于工器屏幕生物碱的绑定。六个生物碱(包括黄连素、jatrorrhizine非洲防己碱、利血平、小檗胺,和汉)络合与目标DNA序列。相对结合亲和力从负离子ESI估计数据,和生物碱显示绑定偏好高GC含量的双工。正离子ESI复合物的质谱也记录下来,相比之下,那些在负离子模式下获得的。只有1:1复杂与观察小檗胺低丰度在积极的离子质谱复合物与其他生物碱是绝对没有的。Collision-induced离解(CID)实验表明,复合物与protoberberine生物碱(小檗碱、jatrorrhizine和非洲防己碱)通过基础分离损失和共价乳沟。相比之下,产品与生物碱离子配合物的光谱利血平,小檗胺,和汉秀的主要损失一个中立生物碱分子,伴随着基础丧失和共价乳沟程度不一样。比较气相行为的配合物与生物碱的传统DNA绑定建议这些生物碱的intercalative绑定模式到目标DNA工器。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
小檗碱	Baculoviral IAP repeat-containing蛋白5	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节
利血平	Baculoviral IAP repeat-containing蛋白5	蛋白质	人类	未知的	不可用	细节