收获候选基因负责严重药品不良反应chemical-protein interactome。
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杨L,陈J L
收获候选基因负责严重药品不良反应chemical-protein interactome。
PLoS第一版杂志。2009年7月,5 (7):e1000441。doi: 10.1371 / journal.pcbi.1000441。Epub 2009年7月24日。
- PubMed ID
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19629158 (在PubMed]
- 文摘
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确定遗传因素负责严重药物不良反应(萨德尔)是至关重要的个性化医疗。然而,全基因组关联研究阻碍由于缺少病例对照样本,和候选基因的选择是有限的,缺乏对萨德尔的潜在机制的理解。我们假设药物导致相同类型的萨德尔可能共享一个共同的机制,针对意外SADR-mediating蛋白质相同。因此我们提出一个方法识别常见的SADR-targets通过建设和矿业的硅片chemical-protein interactome (CPI),一个矩阵之间的绑定的优势162年药物分子导致至少一种类型的萨德尔和845蛋白质。药物共享同一萨德尔结果还发现拥有相似的CPI档案对这845蛋白质集。这种方法确定候选基因的sulfonamide-induced中毒性表皮坏死松解症(十):九种磺胺类药引起十被发现强烈结合MHC I (Cw * 4),而没有一个17控制药物不会引起十被发现绑定到它。通过一个洞察CPI,我们发现Y116S替换MHC I (B * 5703)增强了意想不到的绑定的abacavir抗原表示槽,这也解释了为什么B * 5701,不是B * 5703, abacavir-induced过敏症的风险等位基因。总之,萨德尔目标和特定的非目标可以通过CPI的系统调查,确定生成的重要假设潜在候选基因的实验验证。