说明稳定的中间体在urea-induced展开人类第九碳酸酐酶的途径。
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普拉卡什,迪克西特G之一Meena NK,辛格R, Vishwakarma P, Mishra年代,林恩
说明稳定的中间体在urea-induced展开人类第九碳酸酐酶的途径。
J Biomol结构动力学。2018年7月,36 (9):2391 - 2406。doi: 10.1080 / 07391102.2017.1355847。Epub 2017年7月28日。
- PubMed ID
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28705076 (在PubMed]
- 文摘
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人类第九碳酸酐酶(CAIX)已经作为癌症预后的一个有前途的生物标志物,由于其在各种癌症和限制过度表达在正常组织。然而,有限的信息可以在其生物物理行为。CAIX展开的尿素水溶液使用所有原子分子动力学模拟方法进行了研究。这项研究的结果显示一个稳定的中间状态的演变途径CAIX。在中间的尿素浓度(2.0 - -4.0米),人口众多的蛋白质显示一个类原生结构保持完整的二级结构和疏水接触除了小关整体运动。超出4.0尿素,展开更加渐进的和在8.0 M尿素的结构在很大程度上是由于溶剂效应倒塌了。的疏水性分析表明,接触接触终端阿尔法螺旋分离最初的传播损失的联系人从集中位于β折叠。三级接触减少60 - 65% 7.0 - -8.0 M尿素建议的存在残余结构展开状态和确认结构乱射。自由能景观分析建议展开CAIX存在通过不同的中间状态。