热力学考试硫胺素焦磷酸传感器螺旋的焦磷酸riboswitch。

文章的细节

引用

复制到剪贴板

Furniss年代,格罗弗·N

热力学考试硫胺素焦磷酸传感器螺旋的焦磷酸riboswitch。

RNA。2011年4月,17 (4):710 - 7。doi: 10.1261 / rna.2263211。Epub 2011 3月2。

PubMed ID

21367973 (在PubMed

]

文摘

Riboswitches功能性mRNA控制基因的表达。硫胺素焦磷酸(TPP)结合thi-box riboswitch RNA和变构抑制基因编码的蛋白质参与硫胺的生物合成和运输。硫胺素绑定到嘧啶传感器螺旋焦磷酸和焦磷酸绑定到传感器螺旋导致RNA构象的变化,调节基因的表达。我们检查的内部循环的热力学性质焦磷酸绑定域通过比较野生型构造(RNA WT) 6修改2 x 2凸出的RNA和一个2 x 2凸出的DNA。焦磷酸的野生型构造保留五个守恒的基地传感器领域,其中两个在2 x 2膨胀(C65和G66)。RNA WT构造最稳定(DeltaG度(3)(7)= -7.7千卡每摩尔)在1 M氯化钾pH值7.5。打破* G不匹配的膨胀降低构建稳定的1 ~ 0.5千卡/摩尔,但并不影响镁绑定RNA WT。鸟嘌呤在位置48对RNA-Mg很重要(2)+交互的TPP-binding riboswitch pH值7.5。在9.5毫米的存在镁pH值5.5,凸出的RNA结构的体重平均增加了1.1千卡/摩尔相对于1米盐。形成一个a + C *失配碱基对的贡献约为0.5千卡/摩尔在pH值为5.5,而两个串联+ * C错配碱基对一起贡献了约2千卡每摩尔。

DrugBank数据引用了这篇文章

药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Cocarboxylase	核糖核酸	核苷酸	人类	是的	粘结剂	细节