HLA-E、HLA-F HLA-G多态性:基因组序列定义了模单体型结构和变异生成类基因。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
民众连续波,威廉姆斯LM,摩尔Y, Hyodo H,李党卫军,赵LP Sageshima N, Ishitani Geraghty DE
HLA-E、HLA-F HLA-G多态性:基因组序列定义了模单体型结构和变异生成类基因。
免疫遗传学。2006年5月,58 (4):241 - 51。doi: 10.1007 / s00251 - 005 - 0076 - z。Epub 2006年3月29日。
- PubMed ID
-
16570139 (在PubMed]
- 文摘
-
尽管一些研究,定义了多态的模人类白细胞antigen-E (HLA-E) HLA-F, HLA-G基因,迄今为止大多数多态性研究相关研究这些基因的编码序列中提取出来的。此外,一些差异和歧义在当前可用的数据保存在数据库中。扩大数据和解决一些矛盾的数据,我们定义了协议,允许放大的6到7 kb的连续为每个基因的基因组序列,包括所有的编码和内含子序列,大约2 kb的5’侧翼启动子序列,和1 kb的3 '侧翼序列。使用远程聚合酶链反应(PCR)协议,生成一个或两个PCR产品根据轨迹,放大基因组DNA直接测序完成使用一组约30引物在每个轨迹产生连续的序列数据链。使用这种方法,我们33个基因组dna测序,从亚洲、非洲裔美国人,和白人样本。这个分析的结果证实了几个之前报道的编码序列变异,确定几个新等位基因变异,也定义了广泛的基因内区和侧翼序列的变化。可以构建单体型地图和识别标记单核苷酸多态性,可以用来检测复合变异跨越所有三个基因。