gag pol处理在hiv - 1病毒粒子成熟:系统生物学的方法。

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Konnyu B, Sadiq SK, Turanyi T, Hirmondo R,穆勒B, Krausslich HG, Coveney PV,穆勒V

gag pol处理在hiv - 1病毒粒子成熟:系统生物学的方法。

公共科学图书馆第一版杂志。2013;9 (6):e1003103。doi: 10.1371 / journal.pcbi.1003103。Epub 2013年6月6日。

PubMed ID

23754941 (在PubMed

]

文摘

病毒蛋白水解处理呕吐和Gag pol多蛋白的蛋白酶(PR)感染hiv - 1的生产至关重要,和病毒抑制剂公关是当前的抗逆转录病毒治疗的一个组成部分。复杂性的过程有几层(多个卵裂站点和基质;多个酶形式;公关型材),它要求系统层面的方法来识别关键的漏洞和最佳治疗策略。这里我们提出第一个完整hiv - 1的蛋白水解处理公关反应动力学模型,考虑到所有规范乳沟网站在呕吐和Gag pol,中间产品和酶的形式,酶二聚作用,全身的初始auto-cleavage Gag pol self-cleavage公关。模型允许我们识别病毒粒子的速率限制步骤成熟和成熟动力学参数与最强的影响。使用建模框架,我们预测个体之间的交互和代偿潜力卵裂率和药物,描述过程的时间进程,解释陡峭的剂量反应曲线与公关相关抑制剂药物作用和获得新的见解。虽然结果模型产生的受限制使用简化的假设和参数估计的不确定性,开发框架提供了一个可扩展的开放平台将在未来新的数据和假设。

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药物

奈非那韦