整合在硅-体外肺癌相关肿瘤丙酮酸激酶M2 (PKM2)抑制剂的发现。
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叶旭,孙勇,徐勇,陈震,陆松
整合在硅-体外肺癌相关肿瘤丙酮酸激酶M2 (PKM2)抑制剂的发现。
医学化学,2016;12(7):613-620。doi: 10.2174 / 1573406412666160307151535。
- PubMed ID
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26951145 (PubMed视图]
- 摘要
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背景:肿瘤丙酮酸激酶M2 (PKM2)参与肺癌的糖酵解途径,靶向该激酶已被观察到对非小细胞肺癌(NSCLC)放射增敏。目的:采用硅虚拟筛选和体外激酶测定相结合的方法,从一个包含>400,000个市售化合物的候选文库中发现新的PKM2抑制剂。方法:该方法是一种逐步筛选方案,首先使用经验策略快速排除文库中的不可药化合物,然后采用基于分子对接和分子动力学(MD)的重新记录来识别少量潜在的命中化合物。随后,使用标准激酶测定方案证实了计算结果。结果:萘啶酸、吲哚洛芬、苏木精和水杨酸在微摩尔水平上对PKM2激酶有抑制作用,IC50值分别为53、21、340和128 . m。结论:结构分析表明,氢键、盐桥、pi-pi堆叠和疏水力共同赋予了pkm2抑制剂结合的高稳定性和强特异性。