烟碱乙酰胆碱受体的分子识别:阳离子相互作用的重要性。

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Schmitt JD, Sharples CG, Caldwell WS

烟碱乙酰胆碱受体的分子识别:阳离子相互作用的重要性。

中华医学化学杂志1999年8月12日;42(16):3066-74。

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10447950 (PubMed视图

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摘要

我们探讨了在配体与烟碱乙酰胆碱受体结合中的阳离子相互作用的意义。具体而言，利用半经验分子轨道理论的Austin方法估计了芳香氨基酸侧链与烟碱配体中含阳离子的杂环片段的相互作用。侧链-配体片段对的变分相互作用能(E(i))显示出距离依赖性，并遵循一个莫尔斯样势函数。色氨酸侧链与阳离子片段的相互作用最为明显，其次是酪氨酸和苯丙氨酸。对于给定的侧链，阳离子片段表现出不同的E(i)特征，其中强效烟碱配体epibatidine的氮杂双环[2.2.1]庚烷片段引起了研究集中最大的相互作用能。最重要的是，为许多片段计算的最小能量值与母体配体的结合亲和力相关-我们证明了异戊聚体(alpha4beta2)和同戊聚体(alpha7)烟碱乙酰胆碱受体亚型的情况。此外，摩尔斯样势最小值对应的分子间距离也与高亲和结合相关。为了证实这些发现，在Hartree-Fock 6-31G从头算理论水平上进行了大量并行计算。

引用本文的药物库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
尼古丁	神经元乙酰胆碱受体亚单位β -2	Ki (nM)	4	N/A	N/A	细节