碳酸酐酶抑制剂:叠加与Phe131确定抑制剂活性部位结合地区以membrane-impermeant抗肿瘤的x射线晶体结构磺酰胺与同工酶II。

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Menchise V,德西蒙G, Alterio V,迪菲奥雷,Pedone C, Scozzafava Supuran CT

碳酸酐酶抑制剂:叠加与Phe131确定抑制剂活性部位结合地区以membrane-impermeant抗肿瘤的x射线晶体结构磺酰胺与同工酶II。

J地中海化学。2005年9月8日,48 (18):5721 - 7。

PubMed ID
16134940 (在PubMed
]
文摘

加合物的结构与其它碳酸酐酶II——(4-sulfamoylphenyl-ethyl) 2, 4, 6-trimethylpyridinium高氯酸盐,membrane-impermeant抗肿瘤磺酰胺,报道。苯乙的一部分填充活性部位,使范德华相互作用与侧链Gln192, Val121, Phe131, Leu198 Thr200。2,4,6-trimethylpyridinium功能在范德华距离的脂肪链Ile91参与强劲抵消与Phe131面对面的叠加。分析x射线晶体结构的加合物,观察两种绑定模式:一些抑制剂结合他们的尾巴在疏水活性部位的一半,定义为残留Phe131, Val135, Leu198, Pro202 Leu204。其他衍生品结合他们的尾巴在不同的地区,指向亲水的一半,使强大的并行与Phe131堆积。这种交互方向抑制剂向亲水活性部位的一部分。不可能参加它会导致其绑定在疏水的一半。这些发现适用于设计更好的针对同功酶抑制剂二世,第九,第十二,有些在缺氧肿瘤。

DrugBank数据引用了这篇文章

多肽
的名字 UniProt ID
碳酸酐酶2 P00918 细节
绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
塞来昔布 碳酸酐酶2 Ki (nM) 21 7.5 22 细节
舒必利 碳酸酐酶2 Ki (nM) 40 7.5 22 细节
托吡酯 碳酸酐酶2 Ki (nM) 5 7.5 22 细节