绑定的分子模拟研究zonisamide和托吡酯对人类线粒体碳酸酐酶同种型。

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Vitale RM, Pedone C, Amodeo P, Antel J, Wurl M, Scozzafava, Supuran CT,德西蒙·G

绑定的分子模拟研究zonisamide和托吡酯对人类线粒体碳酸酐酶同种型。

Bioorg医疗化学。2007年6月15日,15日(12):4152 - 8。Epub 2007年3月30日。

PubMed ID

17420132 (在PubMed

]

文摘

Zonisamide和托吡酯两种抗癫痫药物诱发癫痫患者减肥。这些分子最近被证明作为碳酸酐酶(CA)抑制剂,被认为减肥可能是由于线粒体同功酶的抑制CA VA和CA VB参与代谢过程,其中脂类的生物合成。为了更好地理解这些化合物之间的相互作用与中科院,在这里,我们报告一个同源性建模和分子动力学模拟研究他们的加合物与人类碳酸酐酶弗吉尼亚州弗吉尼亚州(hCA)。根据我们的结果,在这两种情况下,抑制剂氨基磺酸盐/磺酰胺基参与规范化与催化锌离子的相互作用,而有机支架建立大量的范德瓦耳斯和极地与活性部位间隙的交互。这些配合物的结构比较与人类相应的同系物碳酸酐酶II (hCA II)提供了一个基本原理的亲和性不同测量这些药物对hCA VA和hCA II。特别是,我们的数据表明,活性部位间隙较窄,加上不同的氢键网络安排hCA VA hCA II相比,可能占zonisamide不同的Kd值和托吡酯对这些生理相关hCA亚型。这些结果提供有用的见解为未来设计的isozyme-selective hCA抑制剂与潜在使用抗肥胖药物具有小说的作用机制。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
托吡酯	碳酸酐酶2	Kd (nM)	13.8	N /一个	N /一个	细节
Zonisamide	碳酸酐酶2	Kd (nM)	47.6	N /一个	N /一个	细节
Zonisamide	碳酸酐酶5,线粒体	Kd (nM)	20.6	N /一个	N /一个	细节