从化合物的三维结构预测hERG活性:基于全局描述子的QSAR模型的开发和评价。

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Sinha N, Sen S

从化合物的三维结构预测hERG活性:基于全局描述子的QSAR模型的开发和评价。

欧洲医学化学杂志2011年2月;46(2):618-30。doi: 10.1016 / j.ejmech.2010.11.042。Epub 2010年12月8日。

PubMed ID

21185626 (在PubMed

］

摘要

基于QSAR的hERG活性预测模型在“全局描述符”方面已经开发和评估。QSAR的开发是通过训练77种化合物，涵盖广泛的活性，并基于使用神经网络方法的80种化合物的外部“测试集”进行验证。统计参数和富集因子检验表明了该模型的有效性。随机化检验验证了模型的鲁棒性，交叉验证检验进一步验证了QSAR的有效性。适用性域检验表明，预测结果具有较高的可靠性。在将化合物分类为“活性”和“非活性”组时也获得了令人满意的性能。在QSAR失败的情况下，讨论了可能的错误来源。

引用本文的药库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
胺碘酮	HERG人心脏K+通道	集成电路50 (nM)	1000	N/A	N/A	细节
Amsacrine	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	208.93	N/A	N/A	细节
阿司咪唑	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	11.48	N/A	N/A	细节
Azimilide	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	562.34	N/A	N/A	细节
Bepridil	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	22.91	N/A	N/A	细节
卡维地洛	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	12589.25	N/A	N/A	细节
氯丙嗪	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	1479.11	N/A	N/A	细节
Cisapride	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	6.76	N/A	N/A	细节
丙吡胺	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	91201.08	N/A	N/A	细节
Doxazosin	HERG人心脏K+通道	集成电路50 (nM)	588.84	N/A	N/A	细节
多虑平	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	6456.54	N/A	N/A	细节
Dronedarone	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	316.23	N/A	N/A	细节
氟卡尼	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	3890.45	N/A	N/A	细节
氟西汀	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	457.09	N/A	N/A	细节
Halofantrine	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	194.98	N/A	N/A	细节
Ibutilide	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	15.14	N/A	N/A	细节
丙咪嗪	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	3388.44	N/A	N/A	细节
氯雷他定	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	173.78	N/A	N/A	细节
Perhexiline	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	7762.47	N/A	N/A	细节
号使用	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	54.95	N/A	N/A	细节
哌唑嗪	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	1584.89	N/A	N/A	细节
普鲁卡因胺	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	138038.43	N/A	N/A	细节
Sertindole	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	14.79	N/A	N/A	细节
它莫西芬	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	1584.89	N/A	N/A	细节
特拉唑嗪	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	17782.79	N/A	N/A	细节
Terfenadine	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	213.8	N/A	N/A	细节
甲硫哒嗪	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	95.5	N/A	N/A	细节
维拉帕米	钾电压门控通道亚族H成员2	集成电路50 (nM)	141.25	N/A	N/A	细节