扩大ChemGPS化学空间与自然的产品。

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拉尔森J, Gottfries J波林L, Backlund

扩大ChemGPS化学空间与自然的产品。

J Nat刺激。2005年7月,68 (7):985 - 91。

PubMed ID

16038536 (在PubMed

]

文摘

最近各种尝试,以提高疗效和精密的化学库用于大规模筛选(高温超导)药物发现方法。ChemGPS就是这样一个方法,它提供了一种定义化学空间试销评价化合物或虚拟dereplication属性。在目前的研究中,ChemGPS被应用到一组天然产品展览cyclooxygenase-1和/或2所示(COX-1/2)抑制。的目的和定义化学性质和连接酶抑制这些观察到的模式,这导致两条线的推理。一方面一些特定功能的这些化合物已确定和讨论。总体考克斯抑制频繁与至少一个环的存在结构,片段展示结构刚度,和一个相对较大的分子大小。“大小”概念包括几个参数,例如,分子体积,重量,数量的债券。另一方面,可能更重要的是,这一意外发现,天然产物研究在很大程度上减少外部定义的ChemGPS化学空间。因此,我们还建议扩大空间自然产品:ChemGPS-NP。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
吲哚美辛	前列腺素合成酶1 G / H	集成电路50 (nM)	10	N /一个	N /一个	细节
吲哚美辛	前列腺素合成酶2 G / H	集成电路50 (nM)	3900年	N /一个	N /一个	细节
白藜芦醇	前列腺素合成酶2 G / H	集成电路50 (nM)	32000年	N /一个	N /一个	细节
万	前列腺素合成酶2 G / H	集成电路50 (nM)	760年	N /一个	N /一个	细节