串联二聚体突变膜片钳数据引导药物与人以太-go-go钾通道结合的对接模型:一种协同方法。

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今井YN，柳S，大木S

串联二聚体突变膜片钳数据引导药物与人以太-go-go钾通道结合的对接模型:一种协同方法。

中华医学化学杂志2009 3月26日;52(6):1630-8。doi: 10.1021 / jm801236n。

PubMed ID

19260734 (PubMed视图

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摘要

为了表征药物与人类hERG相关基因(ether-a-go-go -go)通道的结合，开发了一种将膜片钳实验与对接研究相互作用的协同方法。突变被引入到hERG通道的连接二聚体中，这些二聚体被组装成具有突变对角亚基的异四聚体。电生理学上检测了三种药物(西沙必利、特非那定和N-[4-[[1-[2-(6-甲基-2-吡啶基)乙基]-4-哌啶基]羰基]苯基]甲烷磺酰胺二盐酸盐(e - 4031,1))与一组突变通道的结合亲和力，以评估涉及的残基、残基数量和相对位置。西沙必利和1与相邻亚基上的Tyr652残基互作，特非那定与相邻亚基上的Tyr652残基互作。Phe656参与了三种药物的结合，而Ser624只参与了西沙必利和1。对接模型表明pi-pi和CH-pi相互作用而不是阳离子-pi相互作用在药物与hERG通道的结合中起关键作用。

引用本文的药物库数据

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Cisapride	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	10	N/A	N/A	细节
Terfenadine	钾电压门控通道亚家族H成员2	IC 50 (nM)	30.	N/A	N/A	细节