侧链灵活性在人类ether-a-go-go相关基因钾通道(hERG)匹配配对绑定一起研究表明一个新的通道阻滞剂绑定模式。

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Zachariae U, Giordanetto F, Leach AG)

侧链灵活性在人类ether-a-go-go相关基因钾通道(hERG)匹配配对绑定一起研究表明一个新的通道阻滞剂绑定模式。

J地中海化学。2009年7月23日,52 (14):4266 - 76。doi: 10.1021 / jm900002x。

PubMed ID

19534531 (在PubMed

]

文摘

心脏hERG K(+)通道构成长期和昂贵antitarget制药行业。从研究hERG在其内部绑定腔的灵活性,我们已经开发出一种新的药物绑定hERG结构模型,包括绑定孔隙通道正交对称,因此可以利用4倍的四聚物的通道。这个绑定网站基本由四个酪氨酸侧链补充报道ligand-based药效团。模型能够合理减少hERG效力在匹配的分子对研究和建议设计准则与hERG优化不是简单地依赖减少亲油性。绑定模型也表明分子机制之间的联系的高亲和性hERG绑定和c -型失活。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Cisapride	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	6.7	N /一个	N /一个	细节
号使用	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	54.6	N /一个	N /一个	细节
Sertindole	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	14.7	N /一个	N /一个	细节
Terfenadine	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	213年	N /一个	N /一个	细节
甲硫哒嗪	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	33.2	N /一个	N /一个	细节