调制的结合强度在几类乙酰胆碱酯酶的活性位点抑制剂研究比较结合能分析。

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Martin-Santamaria年代,Munoz-Muriedas J,卢克FJ,加戈F

调制的结合强度在几类乙酰胆碱酯酶的活性位点抑制剂研究比较结合能分析。

J地中海化学。2004年8月26日,47 (18):4471 - 82。

PubMed ID
15317459 (在PubMed
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比较结合能(组合)方法已被用于识别的关键残基结构调节的抑制效力三个不同类型的乙酰胆碱酯酶抑制剂(他克林、huprines dihydroquinazolines)针对这种酶的催化活性位点。扩展的能量所使用的描述符和偏最小二乘方法结合分析一个独特的训练集包含所有化合物产生一个可说明的模型,能够容纳和预测整个系列的抑制剂的活动相当不错(r2 = 0.91和q2 = 0.76, 4个主成分)。一个更健壮的模型(q2 = 0.81和SDEP = 0.25, 3主成分)时获得相同的最优化分析应用于huprines集,但该方法不能提供预测模型对于其他两个家庭当他们分开对待。这一结果似乎表明,浓缩在化学信息带来的包含不同类型的化合物为一个训练集可以是有益的,当一组内部一致的药理数据可以导出。结合模型外部验证时显示预测一组额外的化合物的活动并非受雇于建筑模型。值得注意的是,整个系列中抑制效力的差异被发现是精细的反溶剂静电贡献结合位点和二级网络交互之间建立的抑制剂和一些蛋白质残留不同于那些直接参与配位的锚定。现在可以使用此信息优势的设计更有效的抑制剂。

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绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
3-Chloro-9-Ethyl-6, 7, 8, 9, 10, 11-Hexahydro-7, 11-Methanocycloocta [B] Quinolin-12-Amine 乙酰胆碱酯酶 集成电路50 (nM) 0.32 N /一个 N /一个 细节
他克林 乙酰胆碱酯酶 集成电路50 (nM) 34 N /一个 N /一个 细节
他克林 乙酰胆碱酯酶 集成电路50 (nM) 251年 N /一个 N /一个 细节