发展三维CysLT1 (LTD4)拮抗剂模型与受体的结合氨基酸残基。

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Zwaagstra我,Schoenmakers SH, Nederkoorn PH值,Gelens E, Timmerman H,张MQ

发展三维CysLT1 (LTD4)拮抗剂模型与受体的结合氨基酸残基。

J地中海化学。1998年4月23日,41 (9):1439 - 45。

PubMed ID

9554877 (在PubMed

]

文摘

介绍了分子建模白三烯CysLT1(或LTD4)受体拮抗剂。几种不同结构类型的CysLT1拮抗剂被叠加到新的高度刚性CysLT1拮抗剂8-carboxy-3”——[2 - (2-quinolinyl)乙烯基]黄酮(VUF 5017)来生成一个常见pharmacophoric安排。已知的基础上构效关系的CysLT1拮抗剂,喹啉氮(或bioisosteric等同)和一个酸性函数作为匹配的点。为了优化拟合的酸性的半个所有对手,提出了受体的精氨酸残基的酸性半个互动网站。结合的氨基酸残基到模型显示额外的胍组和氮原子之间的相互作用quinoline-containing CysLT1拮抗剂。在某些情况下,精氨酸甚至可能与pi-clouds CysLT1拮抗剂苯残留。Montelukast对齐(mk - 476)表明,存在一个额外的口袋CysLT1拮抗剂的结合位点。派生模型应该用于更好地理解分子识别的白三烯CysLT1受体。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Cinalukast	半胱氨酰白三烯受体1	Ki (nM)	6.4	N /一个	N /一个	细节
Montelukast	半胱氨酰白三烯受体1	Ki (nM)	0.5	N /一个	N /一个	细节
扎鲁司	半胱氨酰白三烯受体1	Ki (nM)	0.3	N /一个	N /一个	细节