碳酸酸酶抑制剂:与结构相关的环加氧酶II“选择性”抑制剂塞来昔布相比，Valdecoxib结合到人类亚型II的不同活性位点区域。

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Di Fiore A, Pedone C, D'Ambrosio K, Scozzafava A, De Simone G, Supuran CT

碳酸酸酶抑制剂:与结构相关的环加氧酶II“选择性”抑制剂塞来昔布相比，Valdecoxib结合到人类亚型II的不同活性位点区域。

生物医学化学杂志2006年1月15日;16(2):437-42。Epub 2005年11月14日。

PubMed ID

16290146 (PubMed视图

］

摘要

报道了人碳酸酐酶(CA, EC 4.2.1.1)亚型II (hCA II)与临床使用的止痛药valdecoxib加合物的高分辨率x射线晶体结构，作为一种有效的CA II和环氧合酶-2 (COX-2)抑制剂。valdecoxib的电离磺酰胺部分与催化Zn(II)离子配位成四面体几何。该抑制剂的苯异恶唑部分填充活性位点通道，并与Gln92、Val121、Leu198、Thr200和Pro202的侧链相互作用。它的3-苯基位于疏水袋中，同时与各种疏水残基的脂肪侧链(Val135、Ile91、Val121、Leu198和Leu141)建立范德华相互作用，并与Phe131的芳香环(chi1角相对于在天然酶和其他磺酰胺复合物结构中观察到的chi1旋转约90度)形成强偏位的面向堆积相互作用。塞来昔布是一种结构相关的COX-2抑制剂，其x射线晶体结构早前报道过，与valdecoxib相比，它与hCA II的结合方式完全不同。塞来昔布完全填满了整个CA II活性位点，其三氟甲基位于活性位点的疏水部分，对甲酰基位于亲水部分，与Phe131没有相互作用。与塞来昔布相反，valdecoxib围绕连接苯磺酰胺和取代异恶唑环的化学键旋转约90度，允许这些多种有利的相互作用。这些不同的结合模式允许进一步设计属于苯磺酰胺类的各种CA抑制剂。

引用本文的药物库数据

多肽

的名字	UniProt ID
碳酸酐酶	P00918	细节

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
乙酰唑胺	碳酸酐酶1	Ki (nM)	250	N/A	N/A	细节
乙酰唑胺	碳酸酐酶12	Ki (nM)	5.7	N/A	N/A	细节
乙酰唑胺	碳酸酐酶	Ki (nM)	12	N/A	N/A	细节
塞来昔布	碳酸酐酶	Ki (nM)	21	N/A	N/A	细节
Diclofenamide	碳酸酐酶1	Ki (nM)	1200	N/A	N/A	细节
Diclofenamide	碳酸酐酶	Ki (nM)	38	N/A	N/A	细节
Dorzolamide	碳酸酐酶1	Ki (nM)	50000	N/A	N/A	细节
Dorzolamide	碳酸酐酶	Ki (nM)	9	N/A	N/A	细节
Valdecoxib	碳酸酐酶	Ki (nM)	43	N/A	N/A	细节