一个diazirine-based光亲和标签拓扑异构酶II依托泊苷探针。

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齐川阳GL、Yalowich JC。博得纳,吴X, Hasinoff BB

一个diazirine-based光亲和标签拓扑异构酶II依托泊苷探针。

Bioorg医疗化学。2010年1月15;18 (2):830 - 8。doi: 10.1016 / j.bmc.2009.11.048。Epub 2009年11月27日。

PubMed ID

20006518 (在PubMed

]

文摘

依托泊苷是一种广泛使用的抗癌药物目标拓扑异构酶II,一个重要的核酶。然而,尽管事实上它已经在使用和研究了30多年的特定网站的酶结合是未知的。为了确定依托泊苷结合位点(s)在拓扑异构酶II,一个diazirine-based光亲和依托泊苷模拟探针合成及其photoreactivity和生物活性特点。经紫外线照射,diazirine探针迅速产生一种高活性碳烯形成共价加合物包含稳定的碳基债券表明它还应该能够形成稳定的共价加合物与氨基酸残基在拓扑异构酶II。人类白血病K562细胞生长抑制的属性和拓扑异构酶II diazirine调查表明,它针对的是拓扑异构酶ⅱ的方式类似于依托泊苷。diazirine调查也显示通过其能力作为拓扑异构酶ⅱ毒导致拓扑异构酶IIalpha-mediated双链DNA的乳沟。此外,diazirine探针显著增加protein-DNA共价复合形成的光致辐照diazirine probe-treated K562细胞,比etoposide-treated细胞。这一结果表明,用光催化探针形成共价加合物与拓扑异构酶IIalpha。总之,目前表征的化学,生物化学和生物性能的新合成diazirine-based光亲和依托泊苷模拟表明,使用蛋白质组学质谱方法将成为未来驯良的战略依托泊苷结合位点的识别(s)在拓扑异构酶II通过共价标记的氨基酸残基。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
依托泊苷	DNA拓扑异构酶2α	集成电路50 (nM)	56000年	N /一个	N /一个	细节