α(IIb)β的分子模型(3)整合素。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Feuston BP,卡尔伯森通过JC,哈特曼GD
α(IIb)β的分子模型(3)整合素。
J地中海化学。2003年12月4日,46(25):5316 - 25所示。
- PubMed ID
-
14640540 (在PubMed]
- 文摘
-
α(IIb)β的分子模型(3)整合素开发利用(i)。αβ(v)的晶体结构(3),(ii)。α的同源模型(IIb)子域名,和(3)对接的α(IIb)β(3)/α(v)β(3)双重的假定的结合位点和选择性抑制剂α(IIb)β(3)和αβ(v) (3)。因为这些整合蛋白的结合位点是位于两个头之间的接口的单个子单元,只有α(IIb)β(3)头部区域建模。两个循环的三维构象α(IIb),其残留与non-peptide配体绑定,不能仅从同源性α(v)决定的。诱变数据和建模的小配体结合导致了设计合理的循环构象。最后的能量最小化循环构象展览容许φ和ψ角和导致α(IIb)β的结合位点模型(3)符合已知的诱变研究和内部结构活性关系。IIb带电残基α():E117和β(3):R214发现主导ligand-protein绑定交互。发现“exosite”也认定为氢键,疏水或介子与Y190互动,类似于最近提议的绑定模型βα(v) (3)。