成功虚拟筛选新型人碳酸酐酶抑制剂:策略和实验证实。

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葛伦宝,史达博,郭晓明

成功虚拟筛选新型人碳酸酐酶抑制剂:策略和实验证实。

中华医学化学杂志2002年8月15日;45(17):3588-602。

PubMed ID
12166932 (PubMed视图
摘要

化合物文库的虚拟筛选是先导发现过程中高通量筛选的一种替代和补充方法。本文描述了一种寻找人类碳酸酐酶II可能的线索的新策略,该策略应必威国际app用了一种包括基于官能团要求的预选和快速药效团匹配的几个连续分层过滤器协议。通过对结合位点进行复杂的“热点”分析,可以获得合适的药效团,以检测有利于蛋白质-配体相互作用的区域。在随后的步骤中,使用与已知参考配体的分子相似性来重新排序药效团匹配的命中。最后,得分最高的候选蛋白被灵活地停靠在蛋白结合袋中。在对亲和性预测进行检验后,选择了13种化合物进行实验测试。在这13种抑制剂中,有3种是亚纳摩尔的,1种是纳摩尔的,还有7种是微摩尔的抑制剂。通过晶体结构分析,可以确定两个分子的结合模式。在专利文献中搜索显示,新发现的亚纳摩尔化合物包含现有专利尚未涵盖的支架,这一事实最好地支持了所发现的先导物的新颖性。必威国际app

引用本文的药物库数据

多肽
的名字 UniProt ID
碳酸酐酶 P00918 细节
绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
1-甲基-3-氧氧-1,3-二氢苯并[C]异噻唑-5-磺酸酰胺 碳酸酐酶 IC 50 (nM) 245.5 7.4 25 细节
(3-Nitro-4) - 2-Oxo-Pyrrolidin-1-Yl -Benzenesulfonamide 碳酸酐酶 IC 50 (nM) 0.62 7.4 25 细节
乙酰唑胺 碳酸酐酶 IC 50 (nM) 6.7 7.4 25 细节