三维定量构效关系分析的肽底物的哺乳动物H + /肽转运蛋白PEPT1。

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Gebauer年代,克努特我,Hartrodt B, Brandsch M, Neubert K, Thondorf我

三维定量构效关系分析的肽底物的哺乳动物H + /肽转运蛋白PEPT1。

J地中海化学。2003年12月18日,46 (26):5725 - 34。

PubMed ID

14667225 (在PubMed

]

文摘

载体蛋白的利用率PEPT1 peptidomimetic吸收的药物分子是一种很有前途的口服药物管理局和增加生物利用度的策略。在缺乏结构信息的绑定模式PEPT1基质,计算研究探索基质的结构要求和得到一个预测模型,可以用于设计新型的口服药物。比较分子场分析(CoMFA)和一个比较分子相似性指数分析(CoMSIA)进行一系列79 dipeptide-type底物的亲和力数据被收集在一个相同的条件下测试系统。这些研究产生模型与传统的r(2)和旨在系数(q(2))值的0.901和0.642 CoMFA CoMSIA 0.913和0.776。模型是由一个外部验证测试的19个二肽和二肽衍生品。CoMSIA等高线地图是用于识别的识别相关的元素绑定PEPT1基质。定量构效关系模型提供一个3 d的洞察力在基质之间的相互作用和PEPT1在分子水平上,允许亲和常数的预测新化合物。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Aminolevulinic酸	溶质载体家庭15成员1	Ki (nM)	790000年	N /一个	N /一个	细节
Ubenimex	溶质载体家庭15成员1	Ki (nM)	400000年	N /一个	N /一个	细节