分子动力学模拟和MM / GBSA方法调查绑定机制与DPP-IV aminomethylpyrimidine抑制剂。

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夫L,剑G,远华C, C,淮河Z, Mingjuan J

分子动力学模拟和MM / GBSA方法调查绑定机制与DPP-IV aminomethylpyrimidine抑制剂。

地中海Bioorg化学。2011年11月15日,21日(22):6630 - 5。doi: 10.1016 / j.bmcl.2011.09.093。Epub 2011年9月29日。

PubMed ID

21996517 (在PubMed

]

文摘

DPP-IV aminomethylpyrimidines被调查是小说类的抑制剂。在这封信中,绑定机制替代或位置的微小变化如何影响绑定关联五个代表类似物是由分子动力学模拟研究,自由能计算和能量分解分析。守恒的氢键Glu205和Glu206略忙抑制剂具有约束力;范德瓦耳斯相互作用,特别是两个关键接触Tyr547 Tyr666,结合自由能占据主导地位,发挥着至关重要的作用在区分高活跃的抑制剂的低的。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(5)-氨甲基6 - (2,4-Dichlorophenyl) 2 - 3 5-Dimethoxyphenyl Pyrimidin-4-Amine	Dipeptidyl肽酶4	集成电路50 (nM)	0.1	N /一个	N /一个	细节