识别的一个有效工具基于3 d-qsar抑制剂和对接使用feature-shape药效基因的生物活性构象,CDK2 / cyclinA的案例研究。

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Mascarenhas NM,戈沙尔N

识别的一个有效工具基于3 d-qsar抑制剂和对接使用feature-shape药效基因的生物活性构象,CDK2 / cyclinA的案例研究。

J医疗化学2008欧元12月,43 (12):2807 - 18。Epub 2007年10月22日。

PubMed ID

18037537 (在PubMed

]

文摘

本研究提出了一种快速、有效的方法对于识别新型抑制剂的生物活性构象抑制剂。本研究进行CDK2 / CyclinA抑制剂。最活跃的co-crystal结构配位体与CDK2 / CyclinA被转化成一种feature-shape查询。这个查询服务三个目的(i)排列的分子生成3 d-qsar模型,(2)刚性对接活动网站使用黄金,(3)从数据库中提取支安打。统计学上有效3 d-qsar (r(2) = 0.867,问(2)= 0.887)具有良好的外部设置预测(r (pred) (2) = 0.890)。根据停靠构成进行了分析与铰链区域(CDK2 Glu81-Leu83)交互。相当良好的共识评分是使用11得分函数生成的。开发模型被成功地用于识别潜在的导致CDK2 / CyclinA抑制剂。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
N -苯甲酰胺(5-Cyclopropyl-1h-Pyrazol-3-Yl)	细胞周期蛋白依赖性激酶2	集成电路50 (nM)	290年	N /一个	N /一个	细节