联二苯酰胺p38激酶抑制剂4:DFG-in和DFG-out绑定模式。

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RM天使,天使TD, Bamborough P, Bamford MJ,钟CW, Cockerill SG,宣传党卫军,琼斯KL,莱恩DI,龙斯达夫T, Ludbrook年代,皮尔森R,史密斯KJ,志诚PA,萨默斯,沃克

联二苯酰胺p38激酶抑制剂4:DFG-in和DFG-out绑定模式。

Bioorg地中海化学。2008年8月1;18 (15):4433 - 7。doi: 10.1016 / j.bmcl.2008.06.028。Epub 2008年6月12日。

PubMed ID

18602262 (在PubMed

]

文摘

联二苯酰胺(BPAs)是一系列p38alpha MAP激酶抑制剂。化合物能够绑定到激酶DFG-in或DFG-out构象,取决于取代基。x射线、绑定、动能和蜂窝数据所示,提供了迄今为止最详细的比较有效的化合物之间相同的化学系列结合p38alpha构象不同。DFG-out-binding化合物可能比DFG-in-binding更加有效的化合物通过增加他们的大小。出乎意料,化合物绑定到DGF-out构象显示选择性下降。绑定到孤立的酶动力学和化合物对细胞的影响在很大程度上影响激酶构象。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
Doramapimod	增殖蛋白激酶14	Ki (nM)	6.4	N /一个	N /一个	细节
Doramapimod	增殖蛋白激酶14	集成电路50 (nM)	47	N /一个	N /一个	细节
N - (3-cyanophenyl) 2“-methyl-5”——4-biphenylcarboxamide (5-methyl-1 3 4-oxadiazol-2-yl)	增殖蛋白激酶14	Ki (nM)	240年	N /一个	N /一个	细节
N ~ 3 ~ -cyclopropyl-N ~ 4 ~”——(cyclopropylmethyl) 6-methylbiphenyl-3 4 ' -dicarboxamide	增殖蛋白激酶14	Ki (nM)	12	N /一个	N /一个	细节
N ~ 3 ~ -cyclopropyl-N ~ 4 ~”——(cyclopropylmethyl) 6-methylbiphenyl-3 4 ' -dicarboxamide	增殖蛋白激酶14	Ki (nM)	9	N /一个	N /一个	细节
N ~ 3 ~ -cyclopropyl-N ~ 4 ~”——(cyclopropylmethyl) 6-methylbiphenyl-3 4 ' -dicarboxamide	增殖蛋白激酶14	集成电路50 (nM)	18	N /一个	N /一个	细节