药效基因映射的一系列2,4-diamino-5-deazapteridine鸟型结核菌二氢叶酸还原酶的抑制剂。

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Debnath正义与发展党

药效基因映射的一系列2,4-diamino-5-deazapteridine鸟型结核菌二氢叶酸还原酶的抑制剂。

J医学杂志。2002年1月3;45 (1):41-53。

PubMed ID
11754578 (在PubMed
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药效基因假说是一系列的4-diamino-5-deazapteridine抑制剂鸟型结核菌(MAC)和人类的二氢叶酸还原酶(hDHFR)。训练集由20抑制剂被选在每种情况下的信息内容的基础上结构和活动数据软件HypoGen项目所需的催化剂。在MAC DHFR抑制剂的情况下,最好的药效基因的统计和预测价值的四个特点:两个氢键受体(HA),一个疏水(HY)特性,一个芳香环(RA)特性。选中的药效基因假说产生的均方根偏差0.730和相关系数为0.967,成本差异(零成本减去总成本)约为52。药效基因的验证是一个大组测试抑制剂。对于测试系列,一个分类方案被用来区分高度活跃和适度活跃的和不活跃的化合物的基础上,活动范围。这种分类方案比实际估算值更实用,因为这些值对化合物有待测试没有意义,除了它们表示的化合物是否活跃或不活跃的生物测定。训练集的预测活跃的和不活跃的化合物的成功率为100%。测试集的预测活性化合物的成功率大于92%,约7%的预测是活跃不活跃的化合物。这成功的预测进一步验证三对MAC DHFR结构不同的化合物活性。 Two compounds mapped well onto three of the four features of the pharmacophore. The third compound was mapped to all four features of the pharmacophore. This validation study provided confidence for the usefulness of the selected pharmacophore model to identify compounds with diverse structures from a database search. Comparison of pharmacophores for inhibitors of human and MAC DHFR is expected to reveal fundamental differences between these two pharmacophores that may be effectively exploited to identify and design compounds with high selectivity for MAC DHFR.

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