三维定量构效关系(3 d-qsar)模型的小说类piperazine-based stromelysin-1 (MMP-3)抑制剂:应用“分而治之”的策略。

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安布罗斯阿明E,威尔士WJ

三维定量构效关系(3 d-qsar)模型的小说类piperazine-based stromelysin-1 (MMP-3)抑制剂:应用“分而治之”的策略。

J地中海化学。2001年11月8日,44 (23):3849 - 55。

PubMed ID

11689071 (在PubMed

]

文摘

三维定量构效关系(3 d-qsar)模型取得了利用比较分子场分析(CoMFA)小说系列piperazine-based基质金属蛋白酶抑制剂(MMPIs)。stromelysin-1的晶体结构(MMP-3)酶抑制剂,用于识别区域的空间和静电效应与生物活性相关联。训练集由抑制剂(# 10 - 35)的一个子集,这只对于不同取代基(n-alkyl、酰胺、尿素和磺酰胺)哌嗪的远端氮,产生了最预测CoMFA模型,用r(2)值为0.592(旨在)和0.989(传统的);该模型进一步验证使用测试化合物从两个抑制剂子集。调查各种配体构象、抑制剂子集、校准计划和部分电荷形式被要求获得令人满意的模型。最大的成功是通过将惯性对齐与手动调整enzyme-docked抑制剂,以确保抑制剂之间的互补性的取代基构象和结构特点MMP-3 S1-S2”绑定的口袋。关键见解获得的结构活性关系(SAR)从这个分析抑制剂组与实验观察一致stromelysin-1生物活性和结合位点数据拓扑。特别是,当前的研究启示了配体的立体和静电要求绑定到部分solvent-exposed S1-S2”区域。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(N-Hydroxy-1) - 4-Methoxyphenyl Sulfonyl-4-Benzyloxycarbonyl-Piperazine-2-Carboxamide	Stromelysin-1	集成电路50 (nM)	18	N /一个	N /一个	细节