Receptor-based 3 d-qsar检查点Wee1激酶抑制剂的研究。

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Wichapong K,林德纳M, Pianwanit年代,Kokpol年代,Sippl W

Receptor-based 3 d-qsar检查点Wee1激酶抑制剂的研究。

欧元J地中海化学。2009年4月,44 (4):1383 - 95。doi: 10.1016 / j.ejmech.2008.09.027。Epub 2008年9月30日。

PubMed ID

18976834 (在PubMed

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文摘

一百七十四pyrrolo[3上]carbazole-1 3 (2 h、6 h)土卫四衍生品报告的激酶抑制剂Wee1用于分子对接和三维定量构效关系(3 d-qsar)研究。由于三维结构的可用性的Wee1激酶receptor-based对齐策略应用。六个可用Wee1-inhibitor晶体结构进行了分析使用对接程序黄金导致良好的繁殖实验的派生的位置和交互共晶抑制剂。因为只有低相关性对接分数和抑制活动获得了174年系列的抑制剂receptor-based 3 d-qsar进行研究,将数据集划分为144个训练集分子和外部测试组30个化合物。除了配体结合来自对接研究我们测试了其他几个对齐3 d-qsar程序基础分析。最预测模型是获得了黄金的使用对齐对接研究。CoMFA模型被发现健壮(q(厕所)(2)= 0.764 r (2) = 0.870)。模型的预测能力进一步检查执行离开——20%——出去离开——50%——交叉验证(q(2) = 0.747请假0.737 - 20%,离开- 50%)和预测的活动30抑制剂作为外部测试集(r (pred) (2) = 0.790)。一起的图形分析CoMFA等高线图的关键残基结合口袋提供了重要的洞察力有关交互抑制剂。结果不仅提供信息的基本功能强大的Wee1抑制剂还显示使用receptor-based对齐3 d-qsar的优势分析。

DrugBank数据引用了这篇文章

绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
9-HYDROXY-4-PHENYL-6H-PYRROLO[3上]CARBAZOLE-1 3-DIONE	Wee1-like蛋白激酶	集成电路50 (nM)	97年	N /一个	N /一个	细节
(9-HYDROXY-6) - 3-HYDROXYPROPYL 4 - (2-METHOXYPHENYL) PYRROLO[3上]CARBAZOLE-1, 3 (2 h、6 h)土卫四	Wee1-like蛋白激酶	集成电路50 (nM)	30.	N /一个	N /一个	细节